I 1907 blev Yamanashi-præfekturet ramt af voldsomme oversvømmelser forårsaget af en tyfon, der bragte enorme mængder regn med sig, som begyndte at falde den 22. august, hvorfra nedbøren varede ved frem til den 28. august. I denne periode registrerede man over 300 millimeter regn i Kofu og over 700 millimeter i Otsuki, hvilket fik udløst over 3.300 jordskred, da jorden på bjerge og skråninger rev sig løs. Dette var blandt andet med til at blokere og omdirigere præfekturets mange floder, som i forvejen var løbet over deres breder, så flere byer blev ramt af oversvømmelserne, der i sidste ende førte til, at 5.757 huse blev ødelagt, mens 233 mennesker mistede livet. Ydermere blev flere hundrede kilometer af Yamanashi-præfekturets vejnet skyllet bort, og det samme gjorde flere broer samt hundredvis af elmaster, så folk flere steder stod uden strøm, da katastrofen var overstået.
Yamanashi-præfekturet er særligt udsat for oversvømmelser, fordi det er rigt på både floder og bjerge, men skovrydning havde ligeledes været med til at forværre problemet, og man havde derfor oplevet flere store oversvømmelser i slutningen af 1800-tallet, så man faktisk var i gang med at forebygge katastrofer som denne, der var den største af slagsen i nyere tid i Yamanashi-præfekturet. Oversvømmelserne førte derfor til en større udvandring, idet mange beboere flyttede til Hokkaido, der på dette tidspunkt var ved at blive befolket af tilflyttende japanere, mens andre sågar flyttede ud af landet. Indsatsen mod oversvømmelser blev ligeledes styrket for at forhindre disse i fremtiden, men det tog tid at gennemføre, så i de kommende år blev Yamanashi-præfekturet igen ramt af oversvømmelser.