Haguro-pagoden ligger på Haguro-bjerget, som er et af de tre hellige bjerge i Yamagata-præfekturet, der tilsammen er kendt som Dewa-Sanzan. Disse er kendt for at være de ældste tilbedte bjerge i Japan, og derfor er der mange helligdomme og templer på og omkring dem. En anden historisk bygning er altså Haguro-pagoden, der ifølge de officielle kilder blev opført allerede i 937, og af samme grund har bygningen fået status som nationalskat, selvom den ikke er original. Den nuværende struktur blev nemlig opført i 1370'erne og repareret i 1600-tallet. Pagoden er på fem etager og har en højde på 29 meter. Pagoden er dog omringet af træer, som er endnu højere, så den nærmest står gemt væk i naturen, hvilket er et syn, der har gjort pagoden til en populær turistattraktion for sig selv.
Haguro-bjerget ligger uden for byen Tsuruoka, hvorfra man kan komme til bjerget med bus. Ikke så langt fra foden af bjerget finder man Haguro-pagoden på selve bjerget.