Med sine 3776 meter er Fuji-bjerget det højeste punkt i Japan, og så er det tilmed muligt for folk at bestige det, hvilket over en kvart million mennesker hvert år vælger at gøre – primært i løbet af sommeren, hvor sneen på toppen er smeltet. Det er dog sneen, der i vinterhalvåret er med til at gøre Fuji-bjerget til et ikonisk billede på Japan, og det er også i denne periode, hvor man har størst chance for at kunne beundre bjerget på afstand, idet de lave temperaturer betyder færre skyer. Der er flere byer omkring Fuji-bjerget, hvorfra man har mulighed for at betragte det, når vejret tillader det, hvilket nu og da også er muligt fra hovedstadsområdet, men generelt skal man være heldig, hvis man under sit ophold i Japan når at få et komplet syn af Fuji-bjerget.
Hiroshima er en af Japans mest berømte byer, hvilket skyldes et mørkt kapitel i Japans historie, som samtidig har gjort byen til en populær destination blandt turister. Hiroshima var nemlig en vigtig base under Anden Verdenskrig, og derfor blev byen målet for den første atombombe anvendt i krig, da man fra USA’s side valgte at kaste en sådan over byen den 6. august 1945. Størstedelen af Hiroshima blev lagt i ruiner, og i dag står kun en enkelt bygning tilbage som et fredsmonument, der vidner om de rædsler, som krig kan føre med sig. Udover denne er Hiroshima en moderne storby, hvor der er mange andre ting at opleve, og selvom byen blev offer for et atomvåben, så er den radioaktive stråling på et lignende niveau som i mange andre af verdens byer.
Nagoya er blandt Japans største byer. Byens udvikling begyndte med anlæggelsen af Nagoya-borgen i begyndelsen af 1600-tallet, og den blev senere forbundet med Tokyo og Kyoto via anlæggelsen af et vejnet, der gik lige igennem byen. På grund af sin placering ud til Ise-bugten blev Nagoya en populær havneby og er i dag også en af de vigtigste i Japan. Under industrialiseringen blev Nagoya en af Japans største producenter af blandt andet flyvemaskiner og biler – det er blandt andet her Mitsubishi og Toyota blev grundlagt. Under Anden Verdenskrig blev store dele af byen dog lagt i ruiner af bombetogter netop på grund af maskinindustrien, og mængden af historiske bygninger er derfor begrænset. Nu om dage er der derfor tale om en moderne storby, hvor folk primært kommer for at opleve det dynamiske byliv.
Nikko er en by beliggende i Tochigi-præfekturet, der mest er kendt for sit store kompleks af dekorerede helligdomme, som er et af de mest populære turistmål i Japan. Det er nemlig hér den første Tokugawa-shogun, Ieyasu, og hans barnebarn Iemitsu blev stedt til hvile i 1600-tallet, hvor der blev anlagt en rute, som forbandt byen med datidens Tokyo. I dag er det muligt at komme til Nikko med tog via den samme rute, hvilket gør byen populær som en endagstur fra hovedstaden. I Nikko finder man desuden Shinkyo-broen, der er kendt for at være en af Japans tre flotteste broer, og her ligger samtidig et af Japans tre smukkeste vandfald, idet der uden for byen befinder sig en nationalpark, som netop er kendt for sine vandfald men også sine efterårsfarver. Det er desværre ikke muligt at opleve alle Nikkos seværdigheder i løbet af en enkelt dag, men på en endagstur kan man nemt vælge mellem enten de religiøse monumenter i selve byen eller de naturskønne omgivelser i udkanten af den.
Kamakura ligger ud til Sagami-bugten i Kanagawa-præfekturet og er en af de mest eftertragtede turistdestinationer i Japan grundet sin historie, der længe har været præget af buddhismen, af hvilken grund man i byen finder flere templer og heriblandt også en af Japans største Buddhastatuer, der er endt med at blive et symbol på Kamakura. Byen blev Japans politiske hovedsæde tilbage i slutningen af 1100-tallet, hvilket påbegyndte den såkaldte Kamakura-periode, der varede i 150 år. I 1526 blev det meste af Kamakura brændt ned under borgerkrige, og i slutningen af 1800-tallet blev byen offer for de antibuddhistiske bevægelser, der førte til, at flere templer blev udsat for ødelæggelser. Selvom Kamakura er en historisk by, så er mange af bygningerne altså forholdsvis nye konstruktioner grundet de mange ulykker, der har præget byen gennem tiden. Det blev første gang muligt at komme til Kamakura med tog i 1890, og i dag kan man blandt andet komme dertil direkte fra Tokyo, hvilket gør stedet til en attraktiv endagstur.
Miyajima er det populære navn for øen Itsukushima, der ligger i Hiroshima-bugten. Den er en af de mest eftertragtede turistdestinationer i Japan og samtidig et af de helligste steder. For at komme dertil skal man tage en færge, hvilket tager omkring 10 minutter – medmindre man sejler fra Hiroshima, hvorfra rejsetiden er længere. På turen kan man blandt andet se den store torii-port i vandet tilknyttet Itsukushima-helligdommen: Et af de mest kendte scenarier i Japan. Til trods for at Miyajima ellers er en forholdsvis stor ø, så er seværdighederne dog begrænset til havneområdet, hvor de fleste folk derfor holder til, og det er derfor også muligt at besøge Miyajima som en endagstur fra Hiroshima.
Nara var fra 710 til 794 Japans hovedstad, da Kejserfamilien havde palads hér, før de flyttede til Kyoto, som derefter forblev hovedstaden i over 1000 år. Oprindeligt skiftede landet hovedstad, når en ny kejser kom til magten, men Nara var den første by, hvor den japanske kejserfamilie slog sig ned og fortsatte arvefølgen. Nara er dog mest kendt for sine mange templer, idet byen blev et buddhistisk hovedsæde under religionens indtog i landet, hvilket skyldtes forbindelser med Kina. Nara var for eksempel det østlige endepunkt på Silkeruten. Selvom byen den dag i dag er fyldt med moderne huse, så står mange af de gamle templer der endnu, og det er primært disse, som er årsagen til, at turister valfarter til Nara. Men i Nara ligger desuden en park, der er kendt for sine tamme hjorte, som mange ligeledes kommer for at se og interagere med.
Osaka er en af Japans største byer, og det er blandt andet hér, man finder Kansai-lufthavnen, der gør det muligt for internationale turister at rejse med fly til det sydlige Japan. Osaka ligger ud til vandet og har derfor altid fungeret som handelsby, idet man kunne fragte varer fra skibe til de nærliggende hovedstæder. Nu om dage er der tale om en moderne storby, eftersom Osaka blev hovedsæde for den industrielle udvikling i Japan, men byen blev også udsat for massive bombetogter under Anden Verdenskrig, så der herefter var behov for at genopbygge på ny. Mængden af historiske bygninger er derfor begrænset i Osaka, hvor de fleste kommer for at opleve det pulserende storbyliv. I Osaka finder man eksempelvis nogle af landets højeste bygninger.
Kyoto var fra 794 til 1868 Japans hovedstad, indtil Kejserfamilien flyttede til Tokyo. I Kyoto finder man blandt andet det gamle kejserpalads, der under byens grundlæggelse fungerede som dennes arkitektoniske centrum, da man designede byen med udgangspunkt i den daværende kinesiske hovedstad Chang’an. Hovedparten af Kyoto består i dag af moderne bygninger, men her er endnu ikke et væld af skyskrabere som i andre japanske storbyer, da der er en lov, der sætter en grænse for højden på bygningerne i byen. Dog finder man i Kyoto en koncentration af traditionelle bygninger, idet byen ikke blev udsat for store bombetogter under Anden Verdenskrig. Det betyder, at her ikke blot er ældgamle gader, men samtidig et utal af helligdomme og templer i alle egne af byen, hvilket er nogle af Japans mest ikoniske bygninger, som derfor er populære turistattraktioner for både japanere og udlændinge.
Tokyo er Japans hovedstad, og derfor er det hér mange udenlandske turister ankommer til Japan, idet der er to internationale lufthavne tilknyttet Tokyo. Og eftersom Tokyo er en millionby, så er der tale om et enormt metropolområde, hvor der er nok at opleve, hvilket gøres muligt via et kompleks tog- og metrosystem. Tokyo har flere ikoniske steder, som folk kommer for at se, men her er også mange museer, parker, templer og helligdomme, hvor man kan slappe af i den travle storby, der er kendt for sine mange skyskrabere og alsidige oplevelser. Ved at opholde sig i Tokyo kan man samtidig tage på endagsture rundt omkring til andre nærliggende byer – inklusiv Fuji-bjerget.