Den japanske honningbi er en underart af den asiatiske honningbi. Præcis som med almindelige bier, så lever de i kolonier og fremstiller kuber, hvori de producerer honning og opfostrer deres larver. Som regel har disse en kapacitet på 10-15 liter, men japanske honningbier er ikke så produktive som europæiske honningbier, og derfor er disse mere populære blandt japanske biavlere. Europæiske honningbier er imidlertid sårbare over for den japanske honningbis ærkefjende - nemlig den japanske kæmpehveps - fordi de europiske honningbier ikke har noget våben imod disse. Kæmpehvepse er kendte for at kunne ødelægge hele bistæder og massakrere hundredvis af honningbier i løbet af få minutter, men de japanske honningbier har dog udviklet et forsvar, eftersom de indgår i et kollektivt angreb på en dræberhveps og simpelthen koger den ihjel ved at klamre sig om den og vibrere så voldsomt, så temperaturen omkring den stiger til over 46 grader, hvilket kæmpehvepse ikke kan tåle, mens honningbierne derimod kan modstå temperaturer op til 50 grader.
Dette har været medvirkende til at sikre artens overlevelse, så honningbier er ret almindelige i Japan. Som regel bygger de kuber i eller uden på træer i skove, men nu og da hænder det da også, at de slår sig ned i byer, og ofte kan man opleve, hvordan kuberne er fuldkommen dækket af bier. I forhold til europæiske honningbier så stikker japanske honningbier dog ikke så tit, og hvis det så endelig sker, så vil de tabe deres brod og efterfølgende dø. Japanske honningbier er desuden en anelse mindre end den europæiske honningbi, så de næsten har samme størrelse som en spyflye.