I det japanske hav ligger vulkanøen Oshima, det med en størrelse på næsten 10 km2 er den største ubeboede ø i Japan. Iwo Jima er imidlertid dobbelt så stor og er i teorien også ubeboet, men på denne findes imidlertid en militærbase med udstationeret personel fra det japanske forsvar, så der derfor opholder sig mennesker på øen. Oshima er derimod aldeles ubeboet, selvom den gennem tiden midlertidigt har været hjemsted for enkelte mennesker. Nu om dage er der dog kun ganske få bygninger – heriblandt et fyrtårn samt en lille havn, der blandt andet anvendes af forskere, som er nogle af de eneste personer, som vælger at besøge Oshima. Det er ikke, fordi øen er ubeboelig, men den er bare ikke attraktiv – først og fremmest fordi der er tale om en vulkanø, hvor det er svært at stable et funktionelt samfund på benene, men også fordi det er en så fjernt beliggende ø, at man ikke ville have mulighed for at interagere med andre folk på hyppig basis.
Biwa-søen ligger i Shiga-præfekturet og er med sine 670 kvadratkilometer og en omkreds på 235 kilometer Japans absolut største sø, idet den er mere end fem gange større end landets næststørste sø. Flere store floder udspringer fra Biwa, og gennem historien har søen tiltrukket mennesker i en sådan grad, at stort set hele søen nu om dage er omkranset af bymiljøer samt jernbanelinjer, så den altså generelt ikke er præget af naturlige omgivelser. Søen er imidlertid populær blandt fiskere, sejlere og turister, og man kan endda krydse den med båd, ellers er der også en bro på det punkt, hvor den er smallest.
Japans længste trappe består af hele 3333 trin og befinder sig i Kumamoto-præfekturet, hvor opførelsen af den begyndte i 1980. Fem år senere fik den status som Japans længste trappe, da man rundede 2500 trin, men man blev imidlertid ved med at tilføre nye trin, indtil man til sidst havde 3333 af slagsen. Trappen er dermed hele 2,1 kilometer lang, og tager cirka halvanden time at bestige, så det er ikke så underligt, at mange benytter dem som træning, mens folk generelt bare besøger trappen for at klare turen som en personlig udfordring. Trappen blev netop anlagt som en attraktion, som skulle trække folk til lokalområdet, men den har dog også et formål, idet den faktisk leder frem til et tempel. Der er sågar et gelænder, som man kan holde fast i, så man på den ene side kan gå op, mens man på den anden kan gå ned. På vejen er der endda hvileområder og offentlige toiletter.
Japans højeste vandfald er Nachi-vandfaldet, som befinder sig i Nachikatsuura i Wakayama-præfekturet. Dette er 133 meter højt og befinder sig i nærheden af Kumano Nachi Taisha, der er en shintohelligdom, hvorfra man kan nyde synet af vandfaldet, ligesom man kan beundre det ved dets fod. Der ligger også et tempel i området med en kendt pagode, som Nachi-vandfaldet typisk fotograferes med. Vandfaldet er helligt, så hver morgen udfører shintopræster rituelle ofringer til det, og man har da også fundet forskellige artefakter på bunden af det som et bevis på, at vandfaldet i evigheder er blevet tilbedt. Tvillingvandfaldene Hannoki og Shomyo i Toyama-præfekturet er i teorien højere and Nachi-vandfaldet, men disse løber ned langs en vinklet skråning, således at deres faldlængde bliver afbrudt af klippeformationer, og så er kun det ene af de to vandfald aktive året rundt.
Ushiku Daibutsu er Japans største statue, og da den stod færdig i 1993 var det faktisk den største egentlige statue i verden, og den blev dengang opført for at fejre den japanske munk Shinrans fødsel, da det var ham, der grundlagde Shin-buddhismen, hvilket er den mest praktiserede gren af buddhismen i Japan. Det var derfor forholdsvis nemt at samle midler til at opføre statuen, mens en placering var sværere at finde grundet dens højde. Statuen er beliggende i en park i byen Ushiku i Ibaraki-præfekturet, hvor den som noget af det eneste tårner op i landskabet. Ushiku Daibutsu har en højde på 120 meter, hvilket inkluderer en tilhørende piedestal, som det er muligt for folk at gå ind i. Her finder man nemlig et slags museum med forskellige udstillinger – heriblandt 3300 små gyldne Buddha-figurer, ligesom man desuden kan tage en elevator op til et observatorium inde i selve statuens bryst, der befinder sig i 85 meters højde.
Kurobe-dæmningen er med en højde på 183 meter Japans højeste dæmning. Den befinder sig i de japanske alper, hvor den er en del af Tateyama Kurobe Alpine Route og er et populært stop, idet besøgende ikke blot har mulighed for at passere den, men ligeledes se på fra et observationsdæk, når man fra juni til oktober lukker vand ud fra Kurobe-floden, som den er bygget på. Her kan besøgende også sejle rundt med turistbåde og betragte dæmningen fra et andet perspektiv. Dæmningen blev opført fra 1956 til 1963, og i alt 171 arbejdere mistede livet under konstruktionen af den, mens den samlede pris lød på over 51 milliarder yen. Dæmningen er bygget til at producere strøm og forsyne de lokale områder med vand, og dens reservoir indeholder knap 200 millioner kubikmeter vand.
På øen Okinawa ligger Okinawa Churaumi Akvarium, hvilket er det største akvarium i Japan. Da det åbnede i 2002 var det tilmed det største akvarium i verden, indtil det blev overhalet tre år senere. Dog er det nuværende akvarium en ny udgave af det oprindelige, der åbnede allerede i 1976 efter verdensudstillingen på Okinawa året forinden. I dag er Okinawa Churaumi Akvarium et af Okinawas mest populære turistmål, og stedet er blandt andet kendt for at huse eksemplarer af verdens største fisk: hvalhajen, der endda avles i akvariet. Dette er blot en enkelt art ud af de mere end 700 andre, man kan opleve i akvariet, der alt i alt er hjemsted for 11.000 dyr. Akvariet består af intet mindre end 10 millioner liter vand, og den største vandtank, der huser hvalhajerne, indeholder endda 7,5 millioner liter vand, hvilket gør dette til en af de største vandtanke i verden.
Tokyo Skytree er med sine 634 meter verdens højeste tårn samt Japans højeste og verdens næsthøjeste struktur. Der er tale om et TV-tårn som erstatning for Tokyo Tower, idet de høje bygninger i Tokyo forstyrrede signalet, hvorfor der var behov for et højere tårn, hvilket betød, at man i 2008 påbegyndte konstruktionen af Skytree. Tårnet stod færdigt den 29. februar 2012 og åbnede for befolkningen i maj samme år efter et besøg fra Kejseren og Kejserinden. Omkring 1,6 millioner mennesker besøgte tårnet i den første uge, og alle billetter var booket de første to måneder frem. Tårnet indeholder to observatorier – et i 350 meters højde og et andet i 450 meters højde. Begge observatorier gør det muligt for besøgende at betragte Tokyo i en 360 graders vinkel.
Akashi Kaikyo-broen forbinder Honshu med øen Avaji, hvorfra man kan komme videre til Shikoku. Broen fungerer nemlig som en del af en motorvej, som forbinder de to hovedøer med hinanden. Der er tale om en hængebro med en samlet længde 3,9 kilometer, mens spændet mellem de to pyloner er lige godt 2 kilometer langt, hvilket gør Akashi Kaikyo-broen til den anden længste hængebro i verden baseret på spændets længde. Broen strækker sig over Akashi-strædet, der for skibe altid har været farligt at befærde sig på, idet der ofte er storme i området. I 1955 sank to færger i Akashi-strædet, og dette fik den japanske regering til at starte projektet. Det var dog først i 1988, man påbegyndte konstruktionen af broen, der stod færdig 10 år senere i 1998, hvor det var den længste hængebro i verden helt frem til 2022.
Fuji-bjerget, der også er kendt som Fujisan eller Fujiyama, er med sine 3776 meter det højeste bjerg i Japan og det 35. højeste på verdensplan. Der er tale om en kegleformet stratovulkan, der optræder alene i landskabet, hvilket har gjort bjerget ikonisk i flere århundreder – ikke mindst fordi det er muligt at se det fra blandt andet Tokyo på et skyfri dag. Fuji optræder både på gamle træsnit og i moderne reklamer for Japan, og det er naturligvis også et af landets tre hellige bjerge sammen med Haku-bjerget og Tate-bjerget. I 2013 blev Fuji-bjerget tilmed optaget på UNESCOs liste over verdensarv. Krateret på toppen har en diameter på 780 meter og en dybde på 240 meter. Til trods for at der er tale om en vulkan, så er det muligt for folk at bestige Fuji-bjerget, når bjergbestigningssæsonen er åben fra starten af juli til starten af september.