Den 25. juli 1998 blev der holdt en sommerfestival i en bydel i Wakayama, hvilket dog udviklede sig til en lokal tragedie, da 63 mennesker endte med at blive svært syge, mens to voksne og to børn omkom som følge af organsvigt. Det viste sig nemlig, at den karryret, som blev serveret til festivalen, var blevet tilsat arsenik, hvorved man altså havde at gøre med et massedrab. Mistanken faldt herefter hurtigt mod den 37-årige Masumi Hayashi – en hjemmegående husmor med fire børn, idet hun havde været med til at lave maden, og da det tilmed viste sig, at hun følte sig udstødt fra det lokale fællesskab, tolkede man forbrydelsen som en hævnakt. Hun blev efterfølgende dømt til døden.
I 1999 begyndte den 20-årige Shiori Ino at date den 26-årige Kazuhito Komatsu, der dog udgav sig for at være en anden person. Da Shiori fandt ud af, at hun var blevet narret af Kazuhito, valgte hun at slå op med ham, men dette gjorde imidlertid manden så vred, at han besluttede sig for at stalke og chikanere Shiori, hvis liv blev gjort til et helvede. Kazuhito gik endda så langt som at hyre en lejemorder, der den 26. oktober 1999 stak Shiori Ino ned på åben gade. Selvom der var tale om et overlagt drab, så blev Shiori imidlertid udstillet som en styg kvinde i medierne, fordi det var det billede, Kazuhito havde sørget for at tegne af hende ved at udstille hende i lokalsamfundet, men det blev dog senere afsløret, at hun var et offer for stalking, hvilket førte til lovændringer på området. Kazuhito Komatsu nåede at begå selvmord, inden han blev pågrebet, mens hans bror, lejemorderen og hans medhjælpere blev idømt fængsel for deres medvirken.
Shinzo Abe fungerede som Japans premierminister i to perioder fra 2006 til 2007 og igen fra 2012 til 2020, hvor han trådte tilbage som premierminister og som formand for det Liberale Demokratiske Parti grundet helbredsproblemer. Han var dermed den længst siddende premierminister i Japans historie og forblev politisk aktiv, indtil hans liv endte brat den 8. juli 2022. På denne dag var Shinzo Abe nemlig på et besøg i Nara i forbindelse med en valgkampagne, og han holdt i den anledning en offentlig tale ved Yamato-Saidaiji station, hvor han pludselig blev skudt af den 41-årige Tetsuya Yamagami med brug af en hjemmelavet pistol. Shinzo Abe endte med at miste livet, men der var dog ikke tale om et politisk attentat. I stedet var Tetsuya sur over, at Shinzo Abe havde støttet den nyreligiøse sekt Moon-bevægelsen, der ifølge ham havde drevet hans mor ud i økonomiske vanskeligheder. Tetsuya Yamagami blev senere idømt livsvarigt fængsel.
Den 8. juni 2008 blev Tokyo ramt af en af en ufattelig tragedie, da en varebil kørte over for rødt i et lyskryds og dermed bragede ind i en menneskemængde, som var ved at krydse vejen, i den populære bydel Akihabara, hvilket kostede tre personer livet. Chaufføren steg dog ud af varebilen, hvorefter han gav sig til at stikke tilfældige folk ned på gaden, hvilket kostede yderligere fire mennesker livet. Der var nemlig tale om en massakre begået af den 25-årige Tomohiro Kato, der blev pågrebet på stedet. Han blev efterfølgende dømt til døden for at have slået syv mennesker ihjel, hvilket ifølge ham selv skyldtes, at hans liv lå i ruiner, hvilket resulterede i en vrede mod andre mennesker.
Den 1. juni 2004 var to skolepiger alene i et klasseværelse under frokostpausen på en skole i byen Sasebo i Nagasaki-præfekturet, da den kun 11-årige Natsumi Tsuji valgte at skære halsen over på den 12-årige Satomi Mitarai med en medbragt hobbykniv. De to piger var ellers god veninder, men der var opstået splid i forholdet, hvilket fik Natsumi til at reagere på noget overilet vis, da hun simpelthen tog livet af Satomi. At en kun 11 år gammel pige kunne finde på den slags skabte stor forargelse i og uden for Japan, men på grund af hendes unge alder, kunne hun dog ikke blive straffet, og hun blev derfor sendt på en institution, hvor hun kunne gennemgå terapi, samtidig med at hun kunne færdiggøre sin skolegang.
Norio Nagayama valgte som 19-årig at indlede et drabstogt rundt omkring i Japan, hvor han i 1968 slog 4 tilfældige mænd ihjel med en pistol, som han havde stjålet fra en amerikansk flådebase. Dette var i sig selv opsigtsvækkende, men det var dog det efterfølgende retsopgør, der gjorde Norio til en af de mest omtalte drabsmænd i Japans historie, da han grundet sin unge alder var umyndig og derfor slap for at blive dømt til døden. Dette var dog straffen, han i sidste endte modtog efter 10 år, hvor man erkendte, at der var behov for klare retningslinjer, når kriminelle dømmes til døden. Dette førte derfor til implementeringen af en række kriterier kendt som Nagayama-kriterierne, som dommere kan forholde sig til, når de skal vurdere, om en forbrydelse egner sig til dødsstraf.
Tsutomu Miyazaki var en seriemorder, som var aktiv i 1988 og 1989, hvor han endte med at blive en af de mest berygtede i Japan, idet han udså sig små piger som sine ofre. Den 26-årige mand nåede at tage livet af fire piger, før han blev anholdt, og da det kom frem, at han var en såkaldt otaku, som var fan af videospil, manga og anime, førte dette til, at båd otakuer og populærkulturelle medier blev pålagt negative værdier i Japan, før man med tiden erkendte, at Tsutomu Miyazaki var et særtilfælde, der ikke var blevet skadet af medier, men at han derimod kunne dyrke sine pædofile tilbøjeligheder gennem dem. Han endte med at blive dømt til døden for sine forbrydelser.
Nytårsaftensdag 2000 blev den 44-årige Mikio, hans 41-årige kone Yasuko samt parrets to små børn: datteren Niina på 8 og sønnen Rei på 6 fundet døde i deres hjem i Setagaya-distriktet i Tokyo, hvor de alle var blevet stukket ihjel. Der lod til at være tale om et hjemmerøveri, hvor gerningsmanden simpelthen havde opholdt sig i huset efter at have slået dets beboere ihjel, og han efterlod sig dermed også et utal af spor – heriblandt størstedelen af sin påklædning. Politiet kunne dermed give et detaljeret signalement af den skyldige, men alligevel er han aldrig blevet pågrebet, så familiedrabet i Setagaya er endt med at blive en af de mest omtalte drabssager i Japan, fordi man har så mange spor at gå efter, men alligevel er gerningsmanden aldrig blevet pågrebet.
Den 27. maj 1997 blev den 11-årige Jun Hases afhuggede hoved fundet ude foran en skole i Kobe med et håndskrevet brev i munden, der var underskrevet af en person, der kaldte sig selv for Seito Sakakibara. Morderen viste sig dog at være en kun 14-årig dreng ved navn Shinichiro Azuma, der endda havde et andet liv på samvittigheden, idet han tidligere på året havde slået den 10-årige Ayaka Yamashita ned på gaden med en hammer. Shinichiro fantaserede nemlig om at dræbe, og det førte til stor opmærksomhed, at man stod med en 14-årig dobbeltmorder. På grund af hans alder kunne han dog kun idømmes anbringelse på en ungdomsanstalt, men sagen var medvirkende til, at den kriminelle lavalder i Japan blev nedsat til 14 år.
Den 25. november 1988 blev den 17-årige Junko Furuta kidnappet, imens hun var på vej hjem fra skole, hvorefter hun blev holdt fanget af de fire teenagedrenge Hiroshi Miyano, Shinji Minato, Jo Ogura og Yasushi Watanabe, der i de kommende 41 dage torturerede og voldtog Junko på Shinjis værelse i hans forældres hus i Adachi-distriktet i Tokyo. Junko gennemlevede ufattelige pinsler, indtil hun den 4. januar 1989 omkom af sine kvæstelser og herefter blev støbt i cement i en olietønde. Da sagen blev opdaget, satte den fokus på problemet med ungdomskriminalitet, men netop på grund af drengenes alder, så kunne de kun idømmes korte fængselsstraffe for deres ellers bestialske forbrydelse, der er endt med at blive en af de mest omtalte i Japan.